Theo Quyết định, danh mục bí mật nhà nước trong lĩnh vực khoa học và công nghệ được phân loại theo ba cấp độ gồm: Tuyệt mật, Tối mật và Mật, áp dụng đối với các thông tin có liên quan trực tiếp đến quốc phòng, an ninh, bảo vệ chủ quyền quốc gia và lợi ích quốc gia – dân tộc.
Bí mật nhà nước độ Tuyệt mật
Bao gồm các thông tin về nhiệm vụ khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo đặc biệt hoặc chương trình khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo quốc gia đặc biệt phục vụ trực tiếp cho quốc phòng, an ninh, có ý nghĩa quyết định đến khả năng tác chiến, phòng thủ đất nước. Cụ thể là các chương trình, thuyết minh, báo cáo tiến độ, báo cáo kết quả, sản phẩm; báo cáo thẩm định, quyết định phê duyệt, hợp đồng giao nhiệm vụ và các tài liệu liên quan trong toàn bộ quá trình xây dựng, triển khai và đánh giá nhiệm vụ.
Bí mật nhà nước độ Tối mật
Gồm các thông tin về nhiệm vụ hoặc chương trình khoa học, công nghệ và đổi mới sáng tạo đặc biệt có tác động trực tiếp đến quốc phòng, an ninh, bảo vệ chủ quyền quốc gia, nhưng chưa đến mức Tuyệt mật. Nội dung bao gồm các chương trình, báo cáo, sản phẩm khoa học – công nghệ; hồ sơ thẩm định, quyết định phê duyệt, hợp đồng giao nhiệm vụ và tài liệu liên quan.
Bí mật nhà nước độ Mật
Bao gồm các báo cáo, tờ trình, văn bản xin ý kiến về chủ trương, chính sách mới trong lĩnh vực khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số phục vụ quốc phòng, an ninh; chiến lược, quy hoạch, kế hoạch phối hợp giữa Bộ Khoa học và Công nghệ với Bộ Quốc phòng, Bộ Công an.
Ngoài ra, danh mục còn bao gồm: Thông tin về nhiệm vụ khoa học, công nghệ có nội dung liên quan đến quốc phòng, an ninh, chủ quyền lãnh thổ, nhân quyền, tôn giáo, dân tộc, kinh tế – xã hội và y tế đặc biệt quan trọng.
Thông tin về sáng chế phục vụ quốc phòng, an ninh hoặc có ý nghĩa đặc biệt quan trọng đối với phát triển kinh tế – xã hội.
Thông tin liên quan đến năng lượng nguyên tử, an toàn bức xạ và hạt nhân, kế hoạch bảo đảm an ninh cơ sở hạt nhân, ứng phó sự cố bức xạ, hạt nhân.
Văn bản về phân bổ tần số vô tuyến điện, mạng viễn thông dùng riêng phục vụ các cơ quan Đảng, Nhà nước và các công trình viễn thông quan trọng liên quan đến an ninh quốc gia.
Quyết định có hiệu lực kể từ ngày ký (19/01/2026) và thay thế Quyết định số 1294/QĐ-TTg ngày 24/8/2020 và một số nội dung tại Quyết định số 2238/QĐ-TTg ngày 29/12/2020 của Thủ tướng Chính phủ.