Trong quá trình hình thành, Ngành Y tế huyện Tri Tôn đã trải qua những bước phát triển đáng kể, từ cơ sở y tế đầu tiên cho đến sự hợp nhất thành Trung Tâm Y Tế Huyện Tri Tôn ngày nay. Ban đầu, được thành lập từ cơ sở Chi Y Tế cũ và Trường Tiểu Học cộng đồng Việt Nam, Quận Tri Tôn mang tên Ban Quân Dân Y Huyện Tri Tôn, với cơ sở kém cỏi, chỉ có 30 giường bệnh, là điểm khởi đầu cho ngành y tế tại huyện Tri Tôn. Đến năm 1976, Ty Y tế An Giang đã phân công 01 Bác Sĩ và 05 Cán sự cho y tế huyện, từ đó, Chi Y Tế dần chuyển thành Phòng Y Tế (Bệnh Viện Tri Tôn trực thuộc).
Bước phát triển quan trọng tiếp theo là việc khởi công xây dựng Bệnh viện Đa Khoa Huyện Tri Tôn tại địa bàn Khóm 3, Thị trấn Tri Tôn, vào năm 1991. Đây là bước tiến quan trọng, đảm bảo cung cấp dịch vụ y tế đa dạng và chất lượng cho người dân trong khu vực. Tháng 09 năm 2005, UBND tỉnh An Giang ra Quyết định số: 2508/2005/QĐ - UBND ngày 12/09/2005 về việc hành lập Trung Tâm Y Tế Dự Phòng và Bệnh Viện Đa Khoa Huyện, thị xã trực thuộc Tỉnh, đánh dấu bước ngoặt mới trong phát triển của ngành y tế tại huyện Tri Tôn. Vào ngày 07 tháng 11 năm 2017, Trung Tâm Y Tế Huyện Tri Tôn trực thuộc Sở Y Tế An Giang đã được thành lập thông qua Quyết Định số 3348/QĐ-UBND ngày 07 tháng 11 năm 2017 của Uỷ Ban Nhân Dân Tỉnh An Giang, hợp nhất Trung Tâm Y Tế Huyện Tri Tôn và Bệnh Viện Đa Khoa Huyện Tri Tôn. Trung Tâm Y Tế Huyện Tri Tôn bao gồm Bệnh Viện, 15 trạm y tế xã, thị trấn và 79 tổ y tế ấp, tạo thành một mạng lưới y tế cơ sở toàn diện, đáp ứng nhu cầu sức khỏe của cộng đồng.

Sau những bước ngoặt lớn Trung Tâm Y Tế Huyện Tri Tôn không ngừng nỗ lực để nâng cao chất lượng chăm sóc sức khỏe của nhân dân trên địa bàn. Với đội ngũ 348 cán bộ, y bác sĩ và nhân viên y tế, Trung Tâm đã và đang phục vụ một lượng lớn người dân trong việc khám chữa bệnh. Thời gian qua, Trung Tâm luôn chú trọng đến công tác nâng cao trình độ chuyên môn, nhằm thực hiện nhiệm vụ chăm sóc sức khỏe nhân dân một cách ngày càng hiệu quả hơn. Đồng thời, cấp ủy và chính quyền huyện Tri Tôn, cùng với ngành y tế huyện, đã nhận thức được tầm quan trọng và ý nghĩa của việc củng cố và hoàn thiện cơ sở vật chất cũng như nguồn nhân lực của mạng lưới y tế cơ sở. Với sự tập trung củng cố mạng lưới y tế, từng bước, huyện Tri Tôn đã đáp ứng được yêu cầu chăm sóc sức khỏe của nhân dân. Các biện pháp và chính sách này không chỉ giúp nâng cao chất lượng dịch vụ y tế mà còn đảm bảo cho công tác chăm sóc và bảo vệ sức khỏe của cộng đồng một cách toàn diện và hiệu quả.

Việc đầu tư mới, sửa chữa cơ sở vật chất và trang thiết bị chuyên môn cho các trạm y tế đã đóng góp đáng kể vào việc phát huy hiệu quả và nâng cao chất lượng khám chữa bệnh tại tuyến cơ sở cơ sở, nhận được sự tin tưởng, an tâm của nhân dân. Đồng thời, giúp đội ngũ nhân viên y tế thực hiện tốt hơn nhiệm vụ chuyên môn trong các chương trình quốc gia về y tế.
Hiện nay, bình quân mỗi ngày Trung tâm Y tế huyện thực hiện khám, kê đơn trên 200 lượt bệnh nhân; bệnh nhân vào viện điều trị nội trú khoảng 25 bệnh nhân/ngày; trong đó số lượng bệnh nhân khám bảo hiểm y tế và trẻ em dưới 6 tuổi có chiều hướng gia tăng. Để phục vụ ngày càng tốt hơn nhu cầu của nhân dân, ngành y tế huyện Tri Tôn luôn có kế hoạch để ngày càng nâng cao năng lực, chất lượng chăm sóc sức khoẻ cho nhân dân.
Đặc biệt Trung tâm Y tế Tri Tôn đã triển khai khám bảo hiểm y tế bằng thẻ căn cước công dân, ứng dụng công nghệ thông tin trong quản lý bệnh viện, giám định bảo hiểm y tế, bệnh án điện tử tới chẩn đoán, xét nghiệm, khám, chữa bệnh từ xa gắn với quản lý thẻ, thanh toán bảo hiểm y tế cho người lao động. Bằng cách kết hợp y học hiện đại với y học cổ truyền trong phòng bệnh, khám, chữa bệnh và phục hồi chức năng, Trung Tâm Y Tế Tri Tôn đang tạo ra một môi trường chăm sóc sức khỏe toàn diện, đáp ứng đa dạng nhu cầu của người lao động.
Việc nâng cao chất lượng khám chữa bệnh tại Trung Tâm Y Tế và các Trạm Y Tế xã, thị trấn là ưu tiên hàng đầu của ngành y tế huyện Tri Tôn. Đồng thời, công tác giáo dục cán bộ, công chức và viên chức về 12 điều y đức và 10 nội dung về quy định giao tiếp ứng xử do Bộ Y Tế quy định cũng được đặc biệt chú trọng. Bằng việc nâng cao nhận thức và tinh thần trách nhiệm của đội ngũ y tế, ngành y tế huyện Tri Tôn đã tạo ra một môi trường làm việc chuyên nghiệp và phục vụ chu đáo cho người bệnh. Tinh thần, thái độ phục vụ người bệnh được đặt lên hàng đầu, từ đó tạo ra sự hài lòng và tin cậy từ phía người bệnh.
Song song những kết quả đã đạt được trong thời gian tới, Trung Tâm Y Tế huyện Tri Tôn sẽ tập trung vào các mục tiêu phát triển sau: Củng cố và hoàn thiện mạng lưới ngành y tế từ huyện đến xã, đảm bảo thực hiện tốt chức năng nhiệm vụ về khám chữa bệnh, dự phòng, dân số và phát triển. Nâng cao chất lượng hoạt động của mạng lưới y tế dự phòng, đảm bảo khả năng dự báo và kiểm soát các bệnh lây nhiễm, bệnh không lây nhiễm và các bệnh liên quan đến môi trường, lối sống. Tăng cường năng lực y tế dự phòng, thực hiện tốt chương trình mục tiêu Y tế - Dân số, phòng chống thiên tai và ứng phó với biến đổi khí hậu. Phòng chống các dịch bệnh như sốt xuất huyết, tay-chân-miệng, cúm A/H5N1, viêm não virus, và các bệnh dịch khác có nguy cơ bùng phát trong mùa hè. Tăng cường công tác truyền thông giáo dục sức khỏe như ăn uống hợp vệ sinh, không hút thuốc lá, và thúc đẩy vận động thể lực. Củng cố, phát triển và hiện đại hóa mạng lưới vận chuyển cấp cứu ngoại viện trên địa bàn huyện. Nâng cao chất lượng dịch vụ khám chữa bệnh, tăng cường khám chữa bệnh cho các đối tượng chính sách và phối hợp quân dân y.